Одно из самых изолированных обществ мира, Япония одобряла близкородственные браки в высших кругах даже в сравнительно недавнее время. Браки по договоренности между родными и двоюродными братьями и сестрами, дядями и племянницами, тетями и племянниками были настолько широко распространены в Японии, что эксперты по генетике считают, что инбридинг оказал заметное влияние на здоровье нации. Насколько часто близкородственные браки заключались в традиционной Японии, до сих пор плохо исследовано. Одним из индикаторов, во что это могло выливаться, служит исследование Kubo 1959 года, упоминающее тот факт, что до сих пор «согласно феодальной фамильной традиции» в сельских районах отец может жениться на своей дочери, когда ее мать умирает или становится недееспособной.

Kubo делает вывод, что инцест рассматривается как «поведение, достойное похвалы» в многих традиционных сельских семьях. Среди 36-ти случаев инцеста, которые он изучал в Хиросиме, Kubo отмечает нередкое неодобрение семей, живущих в открытом инцестуальном браке, со стороны общества, но сами члены семей не считали такого рода брак чем-то аморальным. Если мужчина не способен выполнять свою роль главы семейства, сын занимает его место и может начать заниматься сексом с своей сестрой для того, чтобы «продемонстрировать, кто в дом хозяин». Остальные члены семьи воспринимают эти акты инцеста как что-то естественное.

До сегодняшнего дня в японских семьях принято спать в одной постели со своими детьми до тех пор, пока они не достигнут возраста 10-16 лет. Недавнее исследование обнаружило, что дочери старше 16-летнего возраста продолжают спать со своими отцами в более чем 20 процентах случаев. Даже когда в доме имеется более десятка отдельных комнат, родители, дедушки и бабушки «чувствуют себя одинокими», если они спят отдельно от своих детей и внуков, и поэтому каждую ночь ложатся в постель вместе с ребенком (в одном исследовании было подсчитано, что средний возраст, когда дети получают право спать одни, — 12.7 лет).

Поскольку многие семьи до сих пор практикуют совместный сон с детьми (dakine co-sleeping) — родители, дедушки или бабушками во сне обнимают ребенка, практика считающаяся «полезной для здоровья взрослых» — и поскольку большинство японских родителей регулярно занимаются сексом в то время, когда ребенок находится в их кровати, то удивительно, как некоторые исследователи могут продолжать утверждать, что ничего имеющего отношения к сексу не происходит с японским ребенком, пока он спит в кровати родителей. Особенно учитывая то, что самих детей никто не спрашивает об их сексуальном опыте.

Благодаря недавним исследованиям, в каменной стене молчания о распространенности инцеста появились бреши. Первое — исследование сексуальности с точки зрения феминизма по методике Шир Хайт, где обнаружилось, что треть респонденток подвергались сексуальному насилию в детском возрасте со стороны родственников или их близких друзей, процент значительно более высокий, чем в похожих американских исследованиях.

Второе, по результатам других исследований, в 1981-м году основная масса родителей, живущих в городской местности, отмечала, что они начали беспокоиться о том, что дети, с которыми они вместе спят в одной постели, в курсе их сексуальных контактов — растущее чувство вины за инсцестуальные действия (которые до недавнего времени также имели широкое распространение на Западе). Что наконец-то привело к мысли о необходимости собственных кроватей для детей.

Третье, две недавно вышедшие книги на тему инцеста в Японии предоставляют материалы для лучшего понимания темы. Одна из них — отчет по материалам горячей телефонной линии, установленной одной из юридических служб Японии. Книга анализирует сотни звонков, связанных с ситуацией инцеста. Поскольку официальная японская статистика отрицает случаи инцеста, сотрудники горячей линии с удивлением обнаружили, что их линия просто наводнена такими звонками. Одной из важных находок была та, что к отец-дочь и брат-сестра случаям инцеста, типичным для Запада, добавились случаи мать-сын, которые составили 29% всех звонков. Это чрезвычайно высокая пропорция по сравнению с другими странами, но она была ожидаема, учитывая распространенность ситуации, когда матери в Японии спят в одной постели с своими сыновьями в отсутствии отца, который в это время занимается сексом с другими женщинами — внебрачные связи до сих пор больше правило, чем исключение для женатых японских мужчин.

И, последнее, недавнее исследование Kitahara о японском детстве предоставляет новые детали о теме инцеста в Японии. Они включают поощрение инцестуальных отношений между братьями и сестрами в ранней истории Японии, рутинное одобрение педерастии, продолжающееся вплоть до настоящего времени, широкое распространение сна в одной кровати и мытья в одной ванне близких родственников.